【扎实做好前期工作】 2006年，省南水北调办公室在原来工作的基础上，组织有关部门和设计单位，认真做好各项前期工作。（1）渠首至黄河南段已纳入总体可研并报国家发改委，初步设计已完成设计招标，中标单位正在进行初步设计。（2）4月28日，国家发改委批复安阳段初步设计概算，总投资20.6亿元。5月30日，水利部批复安阳段初步设计报告；新乡膨胀岩（土）试验段工程投资已经国家发改委核定，水利部已批复初步设计；黄河北至河段初步设计正在报批中。（3）安阳河渠道倒虹吸“四通一平”工程于上年9月9日开工，本年4月中旬完工并通过初验。（4）4月15日，河南省境内南水北调中线干线工程第一份建设管理委托合同———南水北调中线工程黄河北至漳河南工程建设管理委托合同正式签订，拉开了河南省南水北调中线工程建设序幕。（5）认真做好南水北调中线工程景观规划，提出了沿线景观规划的设想和16项重点建筑景观布置节点。焦作市将南水北调工程永久征地外两侧各100米规划为城市生态建设带，郑州市有关部门正在研究在南水北调工程永久征地外两侧各200米规划城市生态建设带。12月4日～7日，吴良镛院士率清华大学南水北调中线工程建筑环境规划组到河南调研，对河南规划工作给予高度评价。（6）文物部门组织省内外34个考古发掘研究单位和高等院校进行有序发掘，已投入资金7500万元。
【配套工程前期工作】 2006年4月，省南水北调办公室组织设计单位对河南省南水北调配套工程规划进行第二次修订；8月22日～23日，召开配套工程修订工作汇报会，听取郑州、漯河、周口等11个受水市和设计单位工作汇报，对输水线路、调蓄工程位置、水厂位置规模和规划建设时间等规划内容进行认真研究；9月中旬，设计单位完成修订规划。修订规划正在征求省发改委、省财政厅等部门的意见，待修改完善后正式上报省政府。南水北调中线工程主要供水目标是城市生活和工业用水，河南省受水城镇42个，其中省辖市11个、县级市7个、县城24个。河南省陶岔渠首分配水量37.69亿立方米，扣除南阳引丹灌区分水量6亿立方米和总干渠输水损失后，总干渠城市分水口门水量为29.79亿立方米；沿途布设分水口门39处，配套工程输水线路总长度981公里，分为管道输水、渠道输水和利用河道输水3种形式，总投资约87.4亿元。
【水源地水质保护及水污染防治】 2006年，省南水北调办公室认真贯彻落实国务院关于《丹江口库区及上游水污染防治和水土保持规划》批复精神，加强水源地水质保护及水污染防治。该《规划》确定河南省环保项目94个、水土保持项目144个，投资27.5亿元，其中近期规划项目145个，投资14.97亿元。省南水北调办公室会同省环保局对做好规划实施各项准备工作进行安排部署，并到水源地对项目单位的前期工作进行调查摸底，制定切实可行的贯彻落实措施。《规划》的可研报告编制工作已经启动。省南水北调办组织有关部门完成了中线工程总干渠环境影响评价和水土保持方案编制工作，并通过了国家相关部门的批复，将与主体工程同步实施。
【加强制度建设】 2006年，省南水北调办公室紧紧围绕主体工程开工，按照南水北调建管局职能，制订工作流程图，在建章立制上下工夫，进一步明确各部门职责。一是结合工作实际，建立健全了各项规章制度，已经完成建管局制度29项，为南水北调各项工作顺利有序进行打下坚实基础。二是制订《河南省南水北调工程建设重特大安全事故应急预案》，对做好河南省南水北调工程建设重特大安全事故应急处理工作、及时有效地预防和控制事故的发生、最大限度减少损失提供了制度保障；成立了河南省南水北调中线工程建设重特大安全事故应急处理领导小组、安全生产委员会和安全度汛领导小组，为南水北调工程建设安全生产工作提供组织保障。三是加强稽查工作，全过程参与了国务院南水北调办公室对穿黄工程建设的稽查活动，认真学习稽查工作的方法、程序等，为河南省开展稽查工作积累经验。
【安阳段工程进展情况】 2006年9月28日，河南省南水北调工程安阳段工程正式开工建设。省市南水北调办、移民办、国土资源厅（局）等部门密切配合，切实做好征地拆迁、协调服务工作，认真贯彻落实征地移民补偿政策，按标准足额补偿，维护群众的正当利益。工程开局良好，进展顺利。截至12月25日，洪河倒虹吸基坑土方开挖累计完成4.5万立方米，占工程量的18.3％；张北河暗渠基坑土方开挖完成4.8万立方米，占工程量的29.4％；文明大道公路桥主渠道土方开挖完成2000立方米，附近主渠道范围内湿陷性黄土重夯试验正在进行。安阳河倒虹吸进展顺利，完成土方开挖1.5万立方米，占工程量的16.2％；出口渐变段地基处理强夯累计完成4000平方米，占设计总量的4.43％；围堰基础高喷灌浆4725延米，占设计总量的35.86％。安阳段工程建设得到了国务院南水北调办公室的充分肯定。
【宣传工作】 2006年9月13日，省南水北调办公室同省政府新闻办联合召开了河南省南水北调工程建设新闻发布会，中央和香港驻豫的媒体以及省内30多个媒体、近60名记者参加了新闻发布会。9月28日，河南省承建的南水北调中线总干渠首开工程———河南段安阳工程正式开工，国家有关部委负责人和省领导出席开工仪式，新华社、《人民日报》、《中国水利报》、中央电视台、中央人民广播电台、《河南日报》、河南电视台、河南人民广播电台等40多个新闻媒体参加开工仪式并及时进行了宣传报道，河南电视台通过卫星向国内外进行了直播，河南人民广播电台进行了实况转播。开工仪式前后，省南水北调办公室还组织有关媒体进行沿线采访，《河南日报》刊登连续报道和专版进行集中宣传报道，《河南商报》、《东方今报》等也整版进行了详尽报道。10月12日和12月6日，省南水北调办公室主任张同立做客大河网和河南人民广播电台《政府在线》节目，在线回答了社会各界普遍关心的有关南水北调的热点问题，取得了理想的宣传效果。